249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4832 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  216  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 219 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 804 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  41.82 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.94 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 		 305 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 488 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 471 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  35 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  33.87 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 490 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 477 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  37.7 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 197 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  31.34 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.81 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 490 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>