139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7081 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 245 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  69.47 
 
 		 119 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 103 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 106 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  68.29 
 
 		 127 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 122 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  65.38 
 
 		 150 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  65.38 
 
 		 120 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 150 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  54.29 
 
 		 99 aa  98.6  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  64.1 
 
 		 114 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  64.1 
 
 		 104 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 116 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  62.82 
 
 		 119 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  67.09 
 
 		 119 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  64.1 
 
 		 89 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  61.54 
 
 		 109 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  62.82 
 
 		 134 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  60.75 
 
 		 118 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  66.18 
 
 		 116 aa  91.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  57.69 
 
 		 108 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  61.54 
 
 		 179 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  62.82 
 
 		 101 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  65.67 
 
 		 112 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 104 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 104 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 104 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 104 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  61.84 
 
 		 101 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 110 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 		 115 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  49.51 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  53.16 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  51.95 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  53.42 
 
 		 91 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  62.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  54.79 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 119 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  59.65 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  49.32 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  40.59 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 156 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  53.7 
 
 		 142 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  41.41 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 183 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  48.08 
 
 		 118 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 		 128 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  45.28 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 140 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 176 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 182 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 117 aa  45.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 128 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  38.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  35 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 107 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 183 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  39.29 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 505 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 500 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 115 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>