225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 191 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 191 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 191 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  35.46 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  25.21 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  36.5 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 197 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  42.03 
 
 		 104 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  23.35 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  30.18 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  23.35 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  22.84 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  22.84 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  31.45 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  23.35 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.45 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 178 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 281 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  25.17 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  30.92 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>