197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0798 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 119 aa  227  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  85 
 
 		 118 aa  159  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  72.36 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  82.29 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  71.58 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  80.77 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  69.31 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  71.13 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  78.21 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  70.33 
 
 		 99 aa  117  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  57.76 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  79.49 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  78.21 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  58.56 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  74.7 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  63.11 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  58.95 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  63.37 
 
 		 179 aa  104  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  58.33 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  73.24 
 
 		 245 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  49.14 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 228 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  69.44 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 191 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  71.62 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  65.28 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  63.89 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  46.9 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  55.42 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  64.62 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  67.95 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  59.72 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  52.08 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  46.81 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  70.42 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  49.32 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  48.68 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 255 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 236 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2559  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 259 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 259 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>