156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0211 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  55.96 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  59.18 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  51.81 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  56.94 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  54.22 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  61.97 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  59.72 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  68.97 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  63.08 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  58.46 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  55.13 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  51.9 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  65.52 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  56.76 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  64.91 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  55.38 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  64.91 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  55.56 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  55.88 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  53.33 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  59.65 
 
 		 245 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  62.07 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  63.16 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  60.66 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  57.89 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  48.05 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  54.93 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  57.89 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  54.22 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  59.72 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  62 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  56.06 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  48.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 428 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 197 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 500 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.13 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 325 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 78 aa  43.9  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 252 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 496 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 505 aa  42.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 345 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>