233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3701 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 140 aa  261  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 101 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  64.79 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  57.75 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  53.42 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  55.71 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  64.29 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  59.7 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  65.38 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  58.54 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  48.05 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.67 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  52.38 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  54.24 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  42.48 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  53.85 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 		 500 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  45.21 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  51.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  47.62 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  51.67 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 169 aa  50.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 252 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  44.78 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4529  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 496 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 505 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 181 aa  47.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  53.45 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  53.23 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  45.07 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  48.33 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 220 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 477 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 325 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 274 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 		 428 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 		 488 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  36.99 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>