97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0229 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 274 aa  538  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  60.52 
 
 		 310 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  61.51 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  61 
 
 		 288 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  60.75 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  60.46 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 272 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 272 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  62.95 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  57.71 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  59.92 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  59 
 
 		 267 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  59.84 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  56.98 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  56.23 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 313 aa  268  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  54.23 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  53.28 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  54.02 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  51.92 
 
 		 288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  56.33 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  54.37 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  53.5 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 271 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  48.09 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  47.84 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  48.81 
 
 		 278 aa  221  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  48.05 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  46.72 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  51.44 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  48.99 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  41.34 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  42.52 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  39.3 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  44.02 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  38.87 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 272 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  33.04 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 195 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  33.7 
 
 		 476 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  38 
 
 		 91 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 200 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 106 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 92 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0779  hypothetical protein  29.84 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.432044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  27.64 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 198 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 84 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 85 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 211 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 194 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>