More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0488 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  65.79 
 
 		 175 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  68.75 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  60.5 
 
 		 277 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 325 aa  137  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  58.4 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 176 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  52.99 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  60.55 
 
 		 162 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  58.49 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  59.46 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 233 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  54.2 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  59.62 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  58.88 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 191 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  58.88 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 191 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  52.34 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  48.54 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  43.81 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  42.7 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  41.57 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  40.45 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 236 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  34.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.3 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  43.64 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  36.67 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>