163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2810 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  65.79 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  73.97 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  64.56 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  49.17 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  71.43 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  70 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  67.14 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  68.57 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  70 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  64.38 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  67.14 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  66.2 
 
 		 179 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  69.57 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  67.14 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  68.57 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.9 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  68.57 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  67.14 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  61.11 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  66.15 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 191 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  51.61 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  60 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  60.61 
 
 		 245 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  53.41 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  64.62 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  56.94 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  75.76 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  58.82 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  55.26 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  59.26 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  44.87 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 192 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  40 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  40 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  40 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 232 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  34.29 
 
 		 503 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 510 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>