98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1471 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  90.89 
 
 		 428 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  835    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  91.12 
 
 		 428 aa  750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  47.59 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1785  helix-turn-helix domain-containing protein  49.88 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00231258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2696  XRE family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0198087  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  28.48 
 
 		 474 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 490 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  27.96 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  27.41 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  26.46 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 482 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  27.09 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 474 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 481 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  26.39 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  26.77 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  28.14 
 
 		 474 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 480 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  26.72 
 
 		 467 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  26.97 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 		 490 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  25.78 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  27.58 
 
 		 524 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  25.94 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  26.83 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  24.56 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  25.71 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  27.89 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  28.38 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  27.56 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  28.54 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  24.52 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  25.06 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  28.51 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  25.43 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  28.22 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  27.11 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  28.71 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  27.14 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  27.14 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 		 471 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  42.86 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 490 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  37.5 
 
 		 209 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 469 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  30 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  35.37 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  36.79 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  41.43 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 139 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 77 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 72 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  28.9 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 104 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 139 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 165 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 89 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 139 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4070  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 109 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00101139  hitchhiker  0.00129674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 175 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>