172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4259 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  295  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  68.82 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  70.37 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  67.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  67.09 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  66.67 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  67.07 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  70.67 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  69.23 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  75.76 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  70.67 
 
 		 99 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  54.7 
 
 		 119 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  67.95 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  70.67 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 122 aa  94.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  66.22 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  63.89 
 
 		 245 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  64.38 
 
 		 91 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  61.33 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  65.33 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 228 aa  90.9  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  64.1 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 191 aa  90.5  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  57.83 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  65.22 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  69.23 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 250 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  69.7 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  59.49 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 260 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  65.67 
 
 		 115 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  56.94 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  57.58 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  56.06 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.1 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  53.7 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 		 225 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 188 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 286 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  35.4 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 200 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  45.61 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  33.85 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 281 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 202 aa  43.9  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 505 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 426 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  27.5 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>