160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3988 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  85.45 
 
 		 110 aa  174  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  83.65 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  83.65 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  83.65 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  68.75 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  59.8 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  54.31 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  69.74 
 
 		 127 aa  103  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  60.64 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  72.37 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  72.37 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  72.5 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  70 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  70.13 
 
 		 179 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  75.36 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  68.29 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  70.89 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  68.42 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  63.64 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  65.82 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  53.47 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  63.38 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  64.29 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  64.84 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 228 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  57.14 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 191 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  48.04 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  67.69 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  67.16 
 
 		 245 aa  84.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 250 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  65.67 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  65.15 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 260 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  60.53 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  69.23 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  56.34 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  56.45 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  55.93 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  58.49 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  43.4 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  39.19 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 496 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  34.12 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  41.27 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 220 aa  42.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 191 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 131 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 232 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 505 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>