56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2601 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  238  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  44.07 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0851  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36492e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.86 
 
 		 508 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.74 
 
 		 206 aa  44.3  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 512 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 126 aa  43.9  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  31.2 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 63 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2591  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 403 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 218 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 253 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0847  hypothetical protein  31.19 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  43.64 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  43.64 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 513 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  28.57 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 285 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>