More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0117 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  77.68 
 
 		 115 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  70.18 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.14 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.14 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 355 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  46.67 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  40 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  37.18 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 380 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 395 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  37.31 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  36.45 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  32.11 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  40.62 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  32.05 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 338 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 359 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.68 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 189 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 268 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  27.78 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  32.05 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  32.05 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  32.05 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 197 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 273 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 261 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 205 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0229  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.790112  hitchhiker  0.00100096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  37.68 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  27.43 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  27.14 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 364 aa  50.4  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  33.01 
 
 		 262 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 328 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.22 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  30.3 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  30.3 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  30.3 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  30.3 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 215 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  30.3 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>