249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1064 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  55.71 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0020  XRE family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  40.54 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  26.43 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 110 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 113 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1157  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 106 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00152463  hitchhiker  0.0000187625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 488 aa  52  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  28.8 
 
 		 139 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 371 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 108 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  44.44 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 490 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 816 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  43.66 
 
 		 414 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 117 aa  49.3  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 131 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 133 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  49.12 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  38.81 
 
 		 133 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 95 aa  48.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  49.12 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 133 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  43.94 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  46.27 
 
 		 68 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 478 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  50.98 
 
 		 104 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 109 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 117 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 105 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  40.3 
 
 		 489 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  40 
 
 		 489 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 96 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0927  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  27.33 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 115 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 321 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>