292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5157 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  220  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0095  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2204  XRE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3187  XRE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5099  XRE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5180  XRE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 107 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0203095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.57 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  35.56 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1157  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00152463  hitchhiker  0.0000187625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  34.95 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  34.95 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  34.95 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  34.95 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  34.95 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 516 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  33.98 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 184 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  36.47 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 199 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  32.04 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  40.91 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  44.62 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  37.8 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  35 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0508  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0116829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 300 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 761 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  40.28 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6541  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 470 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  29.59 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  34.43 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>