116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1157 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1157  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00152463  hitchhiker  0.0000187625 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  61.9 
 
 		 108 aa  140  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  32.38 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  34 
 
 		 258 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  31.88 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  31.88 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0095  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  36.84 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  33.77 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  36.84 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  35.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  35.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  35.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 252 aa  43.5  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2204  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000112019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 516 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 200 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 281 aa  42.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  24.75 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 312 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  33.9 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 259 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 210 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 374 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 215 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 188 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  33.87 
 
 		 233 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  37.1 
 
 		 200 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 200 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 192 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0379  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.808324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  34.78 
 
 		 352 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  35.48 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1656  hypothetical protein  37.14 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0566094  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>