243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4003 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 61 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  52.08 
 
 		 49 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  36.21 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  36.21 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  36.21 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  41.38 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  46.67 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  41.38 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  43.86 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  39.29 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1157  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00152463  hitchhiker  0.0000187625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  39.29 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  39.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  39.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  39.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  39.29 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  43.86 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  37.29 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 279 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  44.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  37.5 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 333 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 333 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35.71 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 469 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0415  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0587851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>