261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0248 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  38.76 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  26.85 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.09 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  40.77 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.71 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  27.94 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  34.67 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.27 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.75 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.47 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.33 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  34.75 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  32.43 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  36.36 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  30.37 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  31.2 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  33.33 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  47.46 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  44.07 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  41.18 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  30.3 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  37.37 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000124238  decreased coverage  8.983340000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  27.92 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.34 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  26.99 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  27.43 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  26.21 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  30 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.81 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  29.37 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.89 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  40 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3116  LexA repressor  34.88 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  30.22 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  34.88 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  44.07 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  44.07 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  39.53 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  26.17 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  45 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00150  LexA repressor  38.82 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  26.94 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  37.21 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  34.31 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  34.88 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2792  LexA repressor  35.35 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  36.47 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  36.47 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  34 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  43.86 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  31.67 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  44.07 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  34.09 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  42.37 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  42.37 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  25 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  45.9 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  45 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  28.57 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  23.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.58 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.43 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  26.27 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.33 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25.2 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  25.2 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.43 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  34.85 
 
 		 149 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 113 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  29.82 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  30.67 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  25.34 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  43.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  43.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  43.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  45 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  45 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  36.05 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.62 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.27 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  39.29 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>