49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0316 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  95.9 
 
 		 244 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  73.48 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  44.3 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  29.37 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  30.37 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.73 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  28.36 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  30.61 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.58 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.93 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.58 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.28 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0048  hypothetical protein  30 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  24.86 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  24.86 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25.64 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  35.38 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  35.38 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.23 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  29.37 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.44 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  33.33 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.82 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  26.51 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  28.12 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  28.32 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  29.05 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.85 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.41 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  24.07 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  25 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  21.35 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  29.58 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  26.45 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  28.03 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  26.45 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  27.27 
 
 		 211 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  37.5 
 
 		 265 aa  42  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>