118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2167 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  93.03 
 
 		 244 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  54.32 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  53.67 
 
 		 218 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  40.96 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  40.32 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  38.8 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  41.53 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  40.49 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  38.87 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  38.96 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  39.36 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  40 
 
 		 233 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  39.6 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  39.27 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  38.55 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  35.52 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  39.52 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  37.25 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  31.76 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  38.68 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  33.86 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  31.34 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.43 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  31.02 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  29.71 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.2 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  30.36 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  34.4 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.1 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  27.45 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  27.8 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  24.21 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.29 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  26.75 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.49 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.82 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  26.78 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  26.21 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.21 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  24.75 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  40.91 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.81 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  23.9 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  40 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  26.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.89 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  24.59 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  24.39 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  27.39 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  25.7 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  43.55 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  22.03 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  26.69 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.6 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4531  helix-turn-helix domain-containing protein  42.03 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  25 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  36.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.45 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  32.21 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.1 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  32.21 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  31.62 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  21.4 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.95 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  32.34 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.17 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.98 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  40.98 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  23.72 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 104 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  38.98 
 
 		 347 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  32.85 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  24.69 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  30.3 
 
 		 120 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  28.74 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.56 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  22.63 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  34.25 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  36.92 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.81 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  22.22 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  23.5 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>