76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0617 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  59.68 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  42.03 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  42.03 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  42.03 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  42.62 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  42.86 
 
 		 263 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  44.62 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  45.31 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  39.71 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  40.3 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 359 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  40.3 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  39.06 
 
 		 302 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  35.94 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  43.55 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  37.7 
 
 		 259 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  42.19 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  40.91 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  40 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  40.32 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  36.62 
 
 		 218 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  36.51 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  40 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  40 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  36.51 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  37.1 
 
 		 251 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  37.5 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  37.5 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  36.36 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  36.36 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5392  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 209 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 222 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  38.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  43.14 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  30.88 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 123 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0928  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 167 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00442924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  40.74 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2413  helix-turn-helix domain-containing protein  44.83 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  29.41 
 
 		 243 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5619  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173792  normal  0.0387834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5240  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  31.51 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 127 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>