151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1249 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  100 
 
 		 218 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  44.08 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  44.08 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  44.08 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  40.35 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  40.35 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  40.28 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  39.9 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  39.13 
 
 		 217 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  38.01 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  36.24 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  37.67 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  34.93 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  39.62 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  35.32 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  36.08 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  35.57 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  33.48 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  35.5 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  34.33 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  35 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  43.2 
 
 		 133 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  31.19 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.03 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  32.29 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.43 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.66 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  39.37 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.66 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  28.1 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  32.34 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  29.15 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  32.8 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  35.2 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.34 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  29.49 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  29.49 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  29.49 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  50 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  50 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  50 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  32.43 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  25.45 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.52 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.52 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  25.99 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  28.16 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.92 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  39.47 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  43.28 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  43.28 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  40.28 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  40.28 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0707  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 104 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0543  helix-turn-helix domain protein  43.75 
 
 		 96 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  39.39 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  39.39 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  35.38 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  36.62 
 
 		 71 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  30.6 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  24.51 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  31.78 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  44.44 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  34.12 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  40.62 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.94 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  24.29 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  30.51 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  22.73 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  29.07 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 108 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25.57 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  37.88 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  31.58 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  23.48 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  27.56 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  23.22 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  24.88 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 108 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  37.88 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>