119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1970 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  69.68 
 
 		 221 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 221 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  61.09 
 
 		 221 aa  298  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  45.71 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  40.91 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  45.71 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  41.36 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  44.08 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  41.41 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  41.41 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  38.33 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  40.39 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  36.41 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  50.77 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  50.77 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  34.84 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  48.84 
 
 		 133 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  31.8 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  31.72 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  35.38 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  32.72 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 204 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  29.82 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  32.72 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  41.73 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  33.97 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  36.23 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  38.26 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  40.5 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  29.73 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.8 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  40 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.71 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.11 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.11 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  26.48 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  26.48 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.85 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  28.11 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  28.11 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  28.11 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  31.85 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  21.15 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  29.03 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  22.77 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  33.6 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  37.21 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  27.22 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  36.9 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  27.54 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  29.47 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  32.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  42.67 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  24.14 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.11 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  31.2 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  31.2 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  26.71 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.71 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  33.33 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  26.32 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  31.2 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.24 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  31.2 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  26.86 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  28.49 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  31.2 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  31.2 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  31.2 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  31.2 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  31.2 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  31.2 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  31.03 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  31.19 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  31.03 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  28.35 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  31.19 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  35.48 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  33.33 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  32.56 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.19 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  26.79 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  33.07 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.37 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  33.72 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  28.86 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  34.07 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>