164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2812 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  93.98 
 
 		 133 aa  262  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  55.76 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  56.87 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  53.27 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  52.76 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  46.38 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  45.41 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  46.38 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  40.28 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  41.78 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  41.78 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  39.91 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  38.79 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  37.12 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  38.68 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  40 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  34.56 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  37.04 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  38.1 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  36.32 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.68 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  35 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.45 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  44.27 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  34.2 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  33.63 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33.33 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.57 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  29.33 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.33 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  31.71 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  28.94 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  26.36 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  30.86 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  33.54 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  25.91 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  26.75 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  26.42 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 245 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  28.44 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  28.87 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.17 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  29.47 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  28.78 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  34.29 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  34.06 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.34 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  27.23 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  27.23 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  27.23 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  28.84 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.91 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.61 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  26.17 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.51 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  45.31 
 
 		 71 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.78 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  35.94 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.75 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.54 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.75 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.76 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  25.91 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  31.08 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.25 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  28.19 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  34.15 
 
 		 158 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  30.95 
 
 		 138 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.47 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.9 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.79 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.19 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.47 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  27.15 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.98 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  29.02 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  26.24 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  35.59 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>