21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4890 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4890  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  330  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  58.11 
 
 		 220 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  43.75 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7538  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  0.0410709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  43.04 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  43.55 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.62 
 
 		 235 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  45.16 
 
 		 259 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  38.37 
 
 		 256 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  37.66 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  34.07 
 
 		 222 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  29.75 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  39.34 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  38.57 
 
 		 244 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>