153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2366 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  43.31 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  32.82 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  31.66 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.16 
 
 
270 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  31.66 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  30.13 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  31 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.75 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.54 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.95 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  29.26 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.31 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.07 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.19 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.4 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.4 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  28.63 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  31.09 
 
 
240 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  28.09 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  27.94 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.66 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  30.59 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  29.21 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  27.23 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.74 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  33.33 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  27.56 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  29.13 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  25 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  29.03 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30.53 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  30.37 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  35.96 
 
 
292 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.15 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.15 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  26.26 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  28.33 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.01 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  27.22 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  32.43 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.93 
 
 
251 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  30.1 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  23.75 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  28.32 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  28.32 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.57 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.02 
 
 
238 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.02 
 
 
238 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  28.28 
 
 
265 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  31.62 
 
 
270 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  24.43 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  35.09 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  29.07 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  27.04 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  31.77 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  28.1 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.47 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  26.29 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  28.3 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  27.78 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  25.34 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  31.54 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  29.41 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  23.62 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.98 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  27.88 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  27.32 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  22.58 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  29.09 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1883  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 
143 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000758221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.5 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  28.27 
 
 
218 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  24.02 
 
 
247 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.49 
 
 
233 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  27.11 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  26.02 
 
 
211 aa  51.6  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  25 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  29.02 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  30.05 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  41.43 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  37.5 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  27.14 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.58 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.1 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.35 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  25.74 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0210  putative prophage repressor  27.92 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  29.41 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  25.38 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  27.08 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  28.8 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  25 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  33.09 
 
 
249 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  25.87 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  26.84 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  25.39 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  29 
 
 
223 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>