73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2211 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  28.5 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  30.77 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  28.5 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  28.02 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  28.44 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  23.94 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  29.11 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.95 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  27.89 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  24.89 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  28.44 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.17 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  26.74 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  24.27 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  27.52 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  27.06 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  23.11 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  25.45 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  25.7 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  23.04 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  25.69 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  22.55 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  24.17 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  27.04 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  24.38 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  23.15 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  24.32 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  24.32 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  24.19 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  25.82 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.23 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  22.77 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  24.06 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  22.51 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  22.51 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  34.62 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  23.11 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  24.23 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.89 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  36.92 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  35.94 
 
 		 131 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  29.03 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  37.1 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  20.28 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  31.88 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  26.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  28 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  39.47 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.2 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  31.88 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  31.88 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  35.94 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  35.94 
 
 		 240 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  27.54 
 
 		 135 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  27.54 
 
 		 135 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  32.94 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.43 
 
 		 138 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>