139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2054 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
229 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  35.12 
 
 
265 aa  85.1  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  29.74 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.49 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  23.63 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  26.69 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25.71 
 
 
256 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.69 
 
 
209 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  25.72 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.8 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  24.08 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  23.83 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  23.6 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  23.6 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.4 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.4 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.69 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  23.02 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  25.5 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  25.32 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  25.49 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  23.14 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  33.91 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.79 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.11 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  37.17 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0910  helix-turn-helix domain protein  39.06 
 
 
130 aa  53.9  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  24.49 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  24.4 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  38.37 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  22.18 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  35.38 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  21.67 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  35.33 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  34.12 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  25.2 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  25.51 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  23.85 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  23.89 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  23.89 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  23.89 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0863  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
130 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  23.27 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  34.68 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  22.51 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0987  XRE family transcriptional regulator  22.51 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.000000124238  decreased coverage  8.983340000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  22.32 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  25.71 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  23.11 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  24.2 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  30.53 
 
 
154 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  23.97 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.8 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  31.15 
 
 
217 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  35.8 
 
 
214 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  25.4 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  25.24 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  27.05 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  24.06 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  23.45 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.4 
 
 
240 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  25.33 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.71 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.91 
 
 
143 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  33.33 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  32.94 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  20.42 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  29.91 
 
 
138 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  24.24 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.71 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  22.18 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.91 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.91 
 
 
138 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 
175 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  37.29 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  23.72 
 
 
241 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  23.48 
 
 
228 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 
171 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  30.33 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.1 
 
 
196 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  29.51 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  23.85 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  37.5 
 
 
293 aa  45.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  27 
 
 
252 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 
128 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.63 
 
 
207 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  28.95 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  29.63 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  29.45 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
123 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.72 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  34.72 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  22.49 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  30.26 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  24.89 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>