28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2265 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  29.84 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  30.08 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  30.08 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1117  hypothetical protein  31 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521607  normal  0.790492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  45.76 
 
 		 235 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  29.25 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  28.46 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  27.03 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  27.03 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  35.51 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1387  putative regulator  43.48 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304686  hitchhiker  4.15524e-17 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  29.27 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2184  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.03 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  36.84 
 
 		 400 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2118  Cro/CI family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  28.21 
 
 		 231 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 		 262 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 262 aa  40  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 262 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  27.05 
 
 		 256 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>