63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0803 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.83 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.83 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  25.77 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 152 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  29.59 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.45 
 
 		 198 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  30.4 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  31.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 104 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.12 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 170 aa  46.6  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  22.87 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  34.18 
 
 		 114 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  22.87 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.21 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.72 
 
 		 217 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 111 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 69 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  20.47 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 69 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 69 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  21.21 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  39.76 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  32.18 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 68 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  30.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.07 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  26.73 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  34.52 
 
 		 815 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  33.33 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  26.45 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  30.11 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  30.11 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  34.74 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  33.87 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.1 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 151 aa  42.4  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  26.51 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 137 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  30.59 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.59 
 
 		 230 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 244 aa  42  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  28.92 
 
 		 240 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  25.74 
 
 		 113 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  28.24 
 
 		 239 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 264 aa  42  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>