156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2209 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  86.21 
 
 		 117 aa  204  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.04 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.04 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.91 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  32.04 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.9 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.9 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  34.41 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.9 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  37.5 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.29 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.69 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  27.97 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  39.66 
 
 		 241 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.82 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  29.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1400  hypothetical protein  36.62 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  25.42 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  32.18 
 
 		 255 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2262  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441916  normal  0.029341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 261 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1203  transcriptional regulator, putative  35.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  28.41 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  39.47 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  30.7 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1149  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.016899  hitchhiker  0.00000234075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 105 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0910  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.27 
 
 		 106 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>