34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0652 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  226  9e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  48.39 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  51.61 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  32.69 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 		 261 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  31.48 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 281 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  26.45 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1344  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.043914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  29.67 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1536  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0904  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  27.96 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  29.06 
 
 		 206 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 137 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1983  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.675652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 115 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>