61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5811 on replicon NC_010183
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  76.26 
 
 		 140 aa  215  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  41.3 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  41.3 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  44.2 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.06 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  39.29 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0555  immunity repressor protein  50.72 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000943913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  33.61 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  44.44 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1344  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.043914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 281 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1536  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0904  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  31.4 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1983  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.675652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  41.27 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5589  putative phage repressor  34.92 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  29.01 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  29.41 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  33.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  33.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  33.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  37.7 
 
 		 270 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  33.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  33.33 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 130 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>