203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1144 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  292  9e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  46.27 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  44.2 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  42.14 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.05 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  38.97 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  34.13 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  34.13 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0555  immunity repressor protein  30.82 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000943913 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 322 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 321 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  32.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 190 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  36.59 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 359 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0020  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 327 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  33.77 
 
 		 393 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 370 aa  48.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 364 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.23 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 300 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.46 
 
 		 436 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  37.29 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.06 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 374 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  43.55 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 512 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  35.71 
 
 		 474 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 374 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  33.85 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 474 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1604  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  29.75 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  26.14 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  31.36 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  35.82 
 
 		 77 aa  43.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 446 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  36.67 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  36.67 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  32.18 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 387 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.8 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>