More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1027 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 321 aa  634    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  46.58 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  44.05 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 133 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 133 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 206 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 104 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  47.69 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 100 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  35.51 
 
 		 143 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 111 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  37.5 
 
 		 114 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 123 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  46.67 
 
 		 117 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  47.62 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  47.62 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 95 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  41.27 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  41.27 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 110 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  43.33 
 
 		 117 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  47.54 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  48.39 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  37.38 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  43.55 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  43.01 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  44.83 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  44.83 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  44.83 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  44.83 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  44.83 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  44.83 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  34.82 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 73 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  45.61 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  42.62 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 115 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 115 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 104 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 139 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 171 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  43.1 
 
 		 125 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40.98 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  43.1 
 
 		 125 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 189 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 74 aa  53.9  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 142 aa  53.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 149 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 104 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 117 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  33.93 
 
 		 374 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 195 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  33.93 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  33.93 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  33.93 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 113 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  26.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 374 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 128 aa  53.1  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 125 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 71 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 141 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 112 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 92 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 139 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 114 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 75 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>