More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3288 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  57.04 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  48.44 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  48.44 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 205 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 369 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  48.33 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  44.26 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  44.26 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 334 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.17 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  36.17 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 364 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  46.03 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.57 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  40.68 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  34.94 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  41.27 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  45 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 361 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  40 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  39.73 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  35.11 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  33.06 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.31 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.05 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  35.9 
 
 		 374 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 374 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  42.25 
 
 		 436 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 374 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.91 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>