More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20950 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  28.86 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.79 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.96 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  24.63 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  26.73 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 114 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  45.45 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  45.45 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.85 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.48 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  32.94 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.94 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.59 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.52 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.19 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.5 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  29.35 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.56 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  27.36 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  30.1 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.9 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  30.53 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.46 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.53 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  34.41 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.06 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  32.56 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  32.56 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.72 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  29 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.18 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 509 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.43 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 504 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.55 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  28.3 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  32.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  32.56 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  38.37 
 
 		 503 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  32.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  32.56 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  32.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  32.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  32.56 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  32.56 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 510 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 510 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0405  putative HTH-type transcriptional regulator  37.21 
 
 		 504 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0652706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  45 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  47.76 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 510 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 490 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  27.89 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 115 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 509 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  38.37 
 
 		 510 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.19 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2560  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 510 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 82 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.64 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 127 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  44.83 
 
 		 125 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25.93 
 
 		 132 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  44.83 
 
 		 125 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.93 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  28.09 
 
 		 819 aa  51.6  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  39.44 
 
 		 511 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>