More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2104 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  40.59 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  33.04 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  48.39 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  41.56 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  41.56 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  41.56 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.76 
 
 		 262 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  37.7 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  39.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.76 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 322 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 301 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  45.9 
 
 		 369 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  36.07 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  37.7 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 364 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  37.7 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  36.49 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  38.71 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  38.71 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  45.61 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  45.61 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 374 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  40.35 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  31.71 
 
 		 328 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 262 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 364 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  37.1 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  37.1 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  37.1 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  37.1 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  37.1 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  52.94 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  37.1 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 71 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 368 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 259 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 359 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  48.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 361 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 374 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 380 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 198 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>