70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0068 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  43.86 
 
 
95 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  39.68 
 
 
386 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 
395 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
327 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 
277 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  30.3 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
207 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
281 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  31.67 
 
 
328 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42 
 
 
418 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
204 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
163 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 
303 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  33.85 
 
 
225 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  30.36 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  38.6 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  28.07 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  34.85 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  31.67 
 
 
302 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  30.36 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  25.76 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  34.38 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  30.36 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  30.36 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.93 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.93 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  35.71 
 
 
114 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 
183 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  30.3 
 
 
87 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 
198 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 
205 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.71 
 
 
114 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
52 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  32.14 
 
 
149 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>