279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1407 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 113 aa  228  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  29.13 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 395 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  43.66 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 304 aa  52  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  39.06 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  26.96 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4413  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 197 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.14 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 211 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4093  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 370 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 374 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  44.83 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  29.76 
 
 		 348 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  29.52 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 497 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 490 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  31.31 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1519  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37865  normal  0.680818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 459 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 321 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  23.08 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 380 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 205 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  36.49 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  40.91 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  29.55 
 
 		 308 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 368 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 		 383 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  28.57 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  24.56 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6134  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  31.43 
 
 		 245 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>