197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3349 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  94.12 
 
 
374 aa  738    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  97.33 
 
 
374 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  96.79 
 
 
374 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  96.79 
 
 
374 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  97.33 
 
 
374 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  100 
 
 
374 aa  772    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  93.32 
 
 
374 aa  727    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  96.52 
 
 
374 aa  749    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  88.43 
 
 
242 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  49.32 
 
 
368 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  44.41 
 
 
374 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  41.76 
 
 
380 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  36.61 
 
 
369 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  29.77 
 
 
372 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  24.24 
 
 
359 aa  125  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  27.75 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  25.46 
 
 
361 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  24.33 
 
 
364 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  27.1 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
163 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30.86 
 
 
114 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  30.86 
 
 
114 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.55 
 
 
194 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 
262 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 
205 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
262 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 
235 aa  60.5  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  39.34 
 
 
142 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  42.62 
 
 
146 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  43.08 
 
 
143 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  36.49 
 
 
145 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  39.13 
 
 
149 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  46.15 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
107 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 
142 aa  58.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  45.28 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
183 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 
142 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  37.68 
 
 
149 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.68 
 
 
92 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  37.68 
 
 
149 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 
272 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 
262 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
149 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  37.68 
 
 
149 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
197 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
139 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  35.53 
 
 
262 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.82 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40.35 
 
 
210 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 
266 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  40.32 
 
 
197 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  43.75 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  35.14 
 
 
186 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 
192 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 
135 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 
196 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.62 
 
 
328 aa  53.9  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 
197 aa  53.1  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 
327 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  35.94 
 
 
144 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  32.5 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 
137 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
170 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
134 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
231 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
185 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  29.41 
 
 
206 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
200 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
137 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
334 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
273 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 
104 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 
125 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
147 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.59 
 
 
67 aa  50.4  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
176 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
197 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
189 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 
189 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
247 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 
196 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
320 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
85 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  31.46 
 
 
255 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
198 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 
95 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  32.79 
 
 
244 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
268 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
131 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 
206 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
144 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>