174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  400  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 
380 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  64 
 
 
459 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  62.71 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  48.39 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 
322 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  46.77 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  43.55 
 
 
142 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 
374 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 
277 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  50 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  48.33 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  47.69 
 
 
92 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  48.33 
 
 
296 aa  58.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  37.68 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  47.69 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  47.69 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  47.69 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 
262 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 
364 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 
262 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 
262 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  46.15 
 
 
149 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  40 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  38.36 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
262 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
368 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
107 aa  54.7  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
327 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  46.15 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  37.37 
 
 
362 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  37.31 
 
 
374 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.04 
 
 
114 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  34.04 
 
 
114 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  37.31 
 
 
374 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  37.31 
 
 
374 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  37.31 
 
 
374 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  37.31 
 
 
374 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  36.07 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  37.31 
 
 
374 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
142 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  37.31 
 
 
374 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  43.42 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  46.27 
 
 
210 aa  52  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
380 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  31.3 
 
 
272 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 
338 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
192 aa  51.2  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  34.33 
 
 
374 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.48 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.33 
 
 
108 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 
85 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.33 
 
 
108 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 
149 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  45.9 
 
 
352 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.5 
 
 
436 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  39.29 
 
 
359 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 
320 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
394 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  34.33 
 
 
369 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  33.9 
 
 
358 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  37.18 
 
 
244 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
268 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  35.59 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  35.8 
 
 
125 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 
388 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  43.28 
 
 
243 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
137 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
312 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3294  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
114 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600359  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
115 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
115 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
115 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  41.3 
 
 
99 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
67 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  46.3 
 
 
348 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>