155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2728 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  51.58 
 
 
189 aa  203  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.45 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  36.6 
 
 
197 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  32.02 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  34.59 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  55.38 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  49.23 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  39.05 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 
322 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
334 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  33.67 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  45.45 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.45 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 
107 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
135 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  43.75 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  34.41 
 
 
92 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  42.19 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
320 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  43.08 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  42.19 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  42.19 
 
 
149 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 
262 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  43.55 
 
 
149 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 
262 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
205 aa  61.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 
459 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 
273 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
380 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
261 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
312 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  44.44 
 
 
293 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  43.55 
 
 
296 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.55 
 
 
114 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.55 
 
 
114 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  42.37 
 
 
240 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
247 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
277 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  46.15 
 
 
359 aa  55.1  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 
338 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1657  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1855  DNA-binding protein  29.37 
 
 
131 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.18378e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  44.23 
 
 
358 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1674  hypothetical protein  29.37 
 
 
133 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  38.71 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
115 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
142 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
113 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
85 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
374 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1190  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
126 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815543  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  33.8 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.34 
 
 
108 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  34.29 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.34 
 
 
108 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  46.67 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.38 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  35.21 
 
 
374 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.1 
 
 
374 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.1 
 
 
374 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.1 
 
 
374 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.48 
 
 
374 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
380 aa  48.5  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  45.28 
 
 
230 aa  47.8  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 
75 aa  47.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  33.87 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 
272 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
118 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  30.86 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
370 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  40.32 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>