196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3112 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.45 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  34.95 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  33.93 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.63 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 358 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  44.62 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  36 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 395 aa  64.7  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  50 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  46.77 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 92 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.55 
 
 		 149 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.26 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  31.45 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 359 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 362 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 369 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 64 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.2 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 83 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 83 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 83 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 83 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  34.92 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 75 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 75 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 75 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 374 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 433 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 370 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1855  DNA-binding protein  31.18 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.18378e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1674  hypothetical protein  31.18 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1657  hypothetical protein  31.18 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 128 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.7 
 
 		 436 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 380 aa  48.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 132 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.79 
 
 		 114 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 63 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  41.94 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  32.79 
 
 		 114 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>