149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1889 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  37.66 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.35 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  31.48 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  32 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  35.21 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 334 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 328 aa  52.8  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 268 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 459 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 327 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 362 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  38.18 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  37.74 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 261 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 65 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.31 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  35.59 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 115 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 115 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 115 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  48.84 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  34.12 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  34.12 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  35.59 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  26 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 358 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  28.4 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  31.07 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 320 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 296 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 128 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  30.16 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  29.67 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.73 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.73 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 118 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.59 
 
 		 68 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  37.5 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 128 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 66 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0469  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 71 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000140129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  36.21 
 
 		 369 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>