174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1096 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  100 
 
 		 362 aa  729    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  35.92 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.04 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  43.98 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  40.09 
 
 		 261 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 395 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  23.9 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  49.23 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  40 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  44.62 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  45.71 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  43.08 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.08 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40.48 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 146 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 142 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 92 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 107 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  26.7 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  36.79 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.08 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  41.54 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.3 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 134 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 235 aa  53.9  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 185 aa  53.1  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 197 aa  53.1  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 250 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 137 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 117 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  39.29 
 
 		 114 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  39.29 
 
 		 114 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 183 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 135 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.4 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 75 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 75 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 75 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 66 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  28.7 
 
 		 240 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 115 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 115 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 133 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 163 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.69 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.69 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.69 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.69 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.69 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.69 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 66 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  40.74 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 118 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 123 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  35.59 
 
 		 206 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 78 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 118 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 210 aa  46.2  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>