More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1673 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  56.16 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  32.38 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  30.59 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  32.38 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  31.42 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05240  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.26 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  30.37 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  30.15 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  28.94 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  32.7 
 
 		 615 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  36.07 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  30.77 
 
 		 642 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.07 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  31.1 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  29.57 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  34.15 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  25.45 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  29.15 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  32.37 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  30.05 
 
 		 343 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  29.91 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3848  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  32.2 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  32.23 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  29.58 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.7 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.87 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  30.58 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  30.58 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  30.81 
 
 		 615 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  30.58 
 
 		 310 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  29.72 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.96 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  34.63 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  30.81 
 
 		 615 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  34.63 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 		 627 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.66 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  28.95 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  29.03 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  31.07 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  33.17 
 
 		 640 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.17 
 
 		 627 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  29.65 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  31.75 
 
 		 618 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  32.02 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  29.63 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  30.41 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  34.47 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  29.58 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  31.69 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  30.19 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  30.09 
 
 		 506 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  30.39 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  28.63 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  28.51 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  27.35 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  29.58 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  29.77 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  31.5 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  28.1 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 620 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5756  ABC transporter related  28.7 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.638783  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  27.88 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  29.55 
 
 		 620 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  30.1 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  32 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  30.95 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  31.92 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.13 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  27.91 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  28.97 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  33.67 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  29.77 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  30.32 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1293  ABC transporter ATP-binding protein  35.24 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0233393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  30.8 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  30.09 
 
 		 506 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  30.91 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  30.46 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  28.51 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  29.86 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>