128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2740 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 395 aa  812    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  26.72 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  28.11 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  26.16 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.96 
 
 		 262 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  28.08 
 
 		 149 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  32.04 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 134 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 92 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 205 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  31.07 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.44 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  32 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  33 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 118 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  36.89 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 135 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 113 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.1 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 204 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 107 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 163 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 115 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 137 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 128 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 183 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 123 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 128 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  46.67 
 
 		 144 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 178 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 176 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 87 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 117 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 197 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 75 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 75 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 75 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  31.43 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  29.52 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  29.52 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  29.52 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 85 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 87 aa  47.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 132 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 72 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 141 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  29.41 
 
 		 227 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  31.15 
 
 		 143 aa  46.6  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 242 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  46.6  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  29.55 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  29.55 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 104 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>