151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1626 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  35.8 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  35.83 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  37.5 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  42.65 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  41.91 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  31.8 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  35 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  45.45 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  29.36 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  26.96 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  33.82 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  27.22 
 
 		 209 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  41.1 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  41.1 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 361 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  43.1 
 
 		 459 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.15 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 142 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  31.82 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  42.62 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  35.59 
 
 		 114 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  35.59 
 
 		 114 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 374 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  31.08 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.79 
 
 		 374 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.18 
 
 		 197 aa  49.7  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 374 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 374 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  31.15 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  31.15 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  27.96 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 374 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 149 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 135 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  33.58 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  30.3 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  32.94 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  39.29 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  28.35 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.77 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  31.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  28.7 
 
 		 546 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  28.44 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  40.3 
 
 		 543 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 380 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  27.59 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  32.1 
 
 		 92 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  32.1 
 
 		 149 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 368 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  23.36 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  28.36 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  42 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 108 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.4 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  39.68 
 
 		 545 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 327 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 108 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  26.26 
 
 		 219 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  24.89 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  43.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>